Расследование начинается с убийства профессора Викентия Себрякова, известного историка, в его петербургской квартире. На место преступления прибывает полицейский следователь Дмитрий Морохин, которому поручено вести дело, несмотря на своё недовольство из-за дилеммы с обширным и сложным следственным материалом. Вместе с ним работает подполковник военной контрразведки Кирилл Сергеевич Ульянов, назначенный для совместного расследования. С самого начала дело оказывается запутанным, так как установление мотивов и поиск важных документов, возможно, пропавших после убийства, осложнены особенностями характера погибшего и его окружения.

В ходе расследования выясняется, что в деле задействованы различные лица, включая женщин из окружения профессора, а также купца Кукушкина, который может помочь установить местонахождение подозрительного жильца доходного дома. Сам Морохин сталкивается с отказом подследственного от дачи показаний, что считается редкостью и серьёзным препятствием для следствия. Это вызывает у него сомнения и дополнительные догадки о глубине и скрытых мотивах преступления. На фоне этого появляются данные о возможной связи убийцы с тайной организацией и о том, что профессор мог быть вовлечён в конспиративные отношения, что ещё больше усложняет ситуацию и расширяет круг подозреваемых....