Амальгама #2: Хозяйка перекрестков начинается с описания тяжёлой и неудобной жизни главной героини Алисы, оказавшейся в плену у похитителей. Её положение безвыходно: она прикована к телеге и страдает от холода и голода. Параллельно развивается история путешествия и перемещений в мире, где обычный транспорт сменяют массивные мохнатые животные, а участники сражений получают награды в виде особых кластеров — амальгамы. Главный герой, Ян, обладает внутренней силой и поддержкой некоего амальгамного существа, которое помогает ему справляться с трудностями. Он сталкивается с различными испытаниями и конфликтами, путешествуя по неблагополучным и опасным местам, где происходят столкновения между группами людей, и где необходимо принимать решения, которые влияют на баланс сил.

Ян оказывается вовлечён в сложные отношения со своими союзниками и противниками. Взаимодействие с Домом Мэй, а также с другими персонажами, такими как Харул и Акамант, усложняет картину происходящего. Герой вынужден учиться доверять и разбираться, кто из окружающих поддержит его, а кто преследует собственные цели. На его пути встают как внешние угрозы — разбойники и труднопреодолимые препятствия, так и внутренние дилеммы по поводу преданности и роли в общем конфликте. Происходят события, демонстрирующие тяготы и последствия ритуалов Жатвы — священного, но опасного процесса, в рамках которого собираются силы и выдаются награды, но также появляются демоны и разрушения....