Сюжет сосредоточен на работе с уникальным материалом — кровью, относящейся к особому «Прототипу 2−0», который представляет большую научную и практическую ценность. Персонажи заняты исследованиями и экспериментами, направленными на понимание и использование свойств этого вещества, однако процесс осложняется необходимостью сохранять полную секретность и избегать внимания высших руководителей Ассоциации. Главным действующим лицом выступает Ито, специалист, которому доверено вести вычисления и теоретическую работу в максимально закрытом режиме, с ограниченной поддержкой помощников и строгими условиями.

Появление новых членов команды, в том числе врача Мори Шиньи и мальчика с противоречивыми чертами, добавляет динамику и сложности в происходящее. Исследовательская группа сталкивается с проблемами, связанными с доступом к материалам, необходимым для продолжения экспериментов, а также с внутренними разногласиями и тонкими политическими нюансами в рамках организации. Дополнительным препятствием становится ситуация с другим участником, Сато Юки, который находится в критическом положении «за вратами», и вопрос о его спасении становится отдельной и важной задачей для команды....